در بخشی از اسناد برملا شده توسط اطلاعات مرکزی آمریکا نامهیی با دست خط اسامه بنلادن وجود دارد که به علی خامنهای رهبر جمهوری اسلامی ایران نوشته شده و از او درخواست کرده تا در حل مشکلات افراد خانوادهاش دخالت کند.
رهبر القاعده به عناصرش هشدار داده است که حکومت ایران شریان اصلی مالی و تسلیحاتی و ارتباطی القاعده است و این گروه با حکومت ایران جنگ ندارد چرا که با آنها منافع مشترک دارد.
در اسناد منتشر شده توسط اطلاعات مرکزی آمریکا اثبات میکنند که رابطه جمهوری اسلامی ایران با گروه القاعده به زمانهای دور بر میگردد و این گروه در داخل خاک ایران آزادی عمل داشته است. همچنین این فرضیه ثابت میشود که حکومت ایران کارت القاعده را در اختیار خود داشته تا در زمان مورد نیاز بتواند آن را بکار گیرد.
لازم به ذکر است که خزانهداری آمریکا اموال شش تن از عناصر القاعده ساکن ایران را بلوکه کرد، امری که نشان میدهد حکومت ایران برای بی ثبات کردن و برهم زدن امنیت کشورهای منطقه به گروههای تروریستی کمک مالی میکرده و در این زمینه نقش مهمی داشته است.